Dovetail Genomics ユーザーミーテイング報告 その１

今日は少し、Dovetailのユーザーミーティングに参加した報告をしたいと思います。
時々PacBioの話題も出てきますよ。

開催された場所は、カリフォルニア州サンタクルーズにあるリゾートホテル。
海外の会社はユーザーミーティングを、ホテルに泊まり込みで2日間とかで行うことが多いですね。

前日は夜にレセプション。初めて会う人がほとんどなので、お酒の力で先に何人かと仲良くなっておくことは良いことです。日本でもやったらいいかも。

準備しているのはロジ担当のニッキー
後ろではもう飲みが始まっている（時刻は午後7時くらい？）

ホテルは街の中心からは離れていて、森があったりして自然豊か！

わかりにくいけどホテルの一部
この先200m歩いていくと会場がある。
同じホテル内なのにめちゃ広い

ホテルの裏にある、自由すぎるハイキングコース

野ウサギも普通にいるほど自然豊か

当日は朝食をみんなで一緒にとってから、9時から開始。
そうです。2日間みんなと共同生活なんです。
でもそこはアメリカ人。皆さん時間には自由です。

会場のテーブルはこの形

Dr. Ed Greenによる発表
彼はDovetailのFounderのひとり

10名くらいのユーザから、いろいろな研究・プロジェクトの発表がありました。
皆さん、Dovetailを使ってはいますが、それ以外のテクノロジーも当然試しているわけで、多かった順にあげると、

1. イルミナショットガン （これは当たり前というか、みんなドラフトでやっていた）
2. PacBio RSII（発表者のほぼ全員が使用。Sequelデータはまだ登場せず。これからでしょうね）
3. 10X（価格が安いからとりあえず10Xで試してみるという意見が多かった）
4. MinION（最近使ってみた、という発表が1人）
5. BioNano（発表では無かったけれどQ&Aの時に話したひとが1人）

それぞれの技術の長所短所は、このブログを読んでいる皆さんならご存知でしょう。
10Xのランニングコストが安いというのは、恥ずかしながら知らなかったのですが、アメリカの非モデル（特に植物）ゲノムアセンブリ業界？では、とりあえず安いから10X試す、というのが定石らしいです。レタスゲノムの先生もそう申しておりました。

ユーザーミーティングでどんな発表があったのか。
続きは「その２」をこうご期待！