2013年10月18日金曜日

PacBio をヒトトランスクリプトーム解析へ Nature Biotech (補足)

先日の投稿の補足です。

CCSを476,000本とるのに何セル使ったのか、どうしても気になったので著者に聞いてみました。
使用したのは35セルだそうです。

40セルくらいかな、と予想した数がまんざら外れてはいませんでした!

彼らがシークエンスした当時のマシンのバージョンは、RS I、使用試薬はXL/C2、Movieは55分 です。
今なら、RS II、P4/C2、120分Movieで読めるので、1セルあたり50,000くらいのCCSはできるだろう、というコメントをいただきました。
それなら10セル程度で、476,000本は取れるでしょう。
良い感じ。

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